Et puis ma réponse précédente pourra peut être aider quelqu'un un jour qui rencontrera ce problème, même si elle ne t'a pas aidé dans ce cas précis.
Pour la batterie, la pause signifie la "non utilisation".
IL serait préférable lorsque tu arrives au boulot, de laisser reposer ton vélo 1h00, puis de la brancher pour recharger.
et le soir de la brancher 1h00 après ton arrivée.
Pas besoin de te lever en pleine nuit

Les batteries sont normalement équipées d'un système "BMS" qui coupe le chargement lorsque la batterie est rechargée, même si celle ci est branchée au chargeur. Ceci évite la surchauffe et la dégradation de la batterie, mais aussi, et surtout, les incendies !!
... ceci dit, personnellement j'ai acheté un petit minuteur que je règle sur 4 heures et comme ça mon chargeur n'est alimenté que sur cette période de charge (il faut environ 3h30 heure pour recharger ma batterie car je n'attend pas qu'elle soit épuisée pour la charger) je charge tous les 25km environ.
Pour les batteries au lithium, il faut éviter les décharges trop profondes.